Druhá etapa rallye nabídla sedm rychlostních zkoušek o celkové délce 85,6 kilometru. Posádky se nejprve vydaly na RZ Práčov, následoval Malšín a závěr patřil legendárním Malontům s délkou přes 26 kilometrů. Úvodních pět kilometrů rychlostní zkoušky Práčov ovládl Filip Mareš s Toyotou GR Yaris Rally2. Jan Kopecký na něj ztratil 1,2 vteřiny, což však nijak neohrozilo jeho celkové vedení. Smolař z předchozího dne, Simon Wagner s Hyundaiem, dojel třetí se ztrátou pouhých 1,3 vteřiny na Mareše a začal stoupat v průběžném pořadí. RZ Práčov bohužel znamenala konec pro rakouského jezdce Ernsta Hanedera. Na druhé sobotní rychlostní zkoušce, desetikilometrovém Malšíně, byl nejrychlejší Jan Kopecký. Filip Mareš na něj ztratil jen 0,7 vteřiny, avšak v průběžném vedení se nic nezměnilo. Bernard Mann s Mitsubishi Lancer EVO IX havaroval za letmým cílem tohoto úseku. První průjezd Malonty přinesl změny v průběžném pořadí, i když na čele zůstal Kopecký. Filip Mareš se s Toyotou dostal do hodin a mimo trať, což ho stálo téměř půl minuty na vedoucího Kopeckého. Do cíle Malont dorazil až jako desátý nejrychlejší. Naopak Erik Cais zajel druhý nejrychlejší čas a posunul se před Mareše v průběžném pořadí. Jan Kopecký si i zde připsal nejrychlejší čas a navýšil své vedení na 36,2 vteřiny. Simon Wagner se díky třetímu nejrychlejšímu času posunul na průběžné sedmé místo. Aleš Jirásek ve Škodě Fabia R5 měl rovněž hodiny s výletem mimo trať a Martina Radu (Fiat 124 Abarth RGT) postihl dvojitý defekt. V kategorii historických automobilů dominoval Vlastimil Neumann s Martinem Hlavatým a jejich Mitsubishi Lancer EVO III, kteří zvítězili stylem start-cíl. Vyhráli všechny rychlostní zkoušky, které se jely. Druhé místo obsadili Jiří Kašpar s Pavlem Adámkem se Škodou 130 LR a třetí skončili bratranci Jurečkové se Subaru Impreza 555. Jindřich Štolfa a Zdeněk Hawel bohužel ani letos neprolomili smůlu, když jejich Ford Escort RS 1600 zastavila porucha spojky v závěrečné rychlostní zkoušce. Sobotní průjezd super rychlostní zkouškou CB Auto Rallye Aréna se stal kořistí Filipa Mareše, jehož Toyota je na této specifické RZ nepřekonána. Po absolvování této divácké erzety zamířily posádky na půlhodinový servis. Opakovaný průjezd krátkým Práčovem nepřinesl žádné změny v průběžném pořadí. Nejrychlejší byl Simon Wagner, následovaný Janem Kopeckým s vteřinovou ztrátou. Na Malšíně s minimálním náskokem 0,2 sekundy zvítězil Jan Kopecký, druhý dojel Simon Wagner. Erik Cais zajel čtvrtý čas a zmenšil tak náskok na třetího Mareše na 6,9 vteřiny. Závěrečná rychlostní zkouška, legendární Malonty, rozhodla o konečném pořadí. Nejrychleji ji zajeli Simon Wagner s Hannou Ostlenderovou, což je posunulo na celkové šesté místo. Erik Cais si druhým nejrychlejším časem na tomto úseku pojistil celkové druhé místo v celé soutěži. Třetí do cíle dorazil Filip Mareš, který obsadil bronzovou příčku v absolutním pořadí závodu. I přes čtvrtý čas na Malontech, který byl o 0,5 vteřiny lepší než při prvním průjezdu, si Jan Kopecký s Jiřím Hovorkou s přehledem dojeli pro absolutní vítězství na 52. Rallye Český Krumlov 2025.

1. Kopecký / Hovorka – Škoda Fabia RS Rally2 1:18:35,2 2. Cais / Trunkát – Hyundai i20N Rally2 +36,9 3. Mareš / Bucha – Toyota GR Yaris Rally2 +45,3 4. Stříteský / Bacigál – Škoda Fabia RS Rally2 +1:31,6 5. Kundlák / Baran – Škoda Fabia R5 +1:47,0 6. Wagner / Ostlenderová – Hyundai i20N Rally2 +1:50,6 7. Březík / Krajča – Škoda Fabia RS Rally2 +1:57,1 8. Von Thurn und Taxis / Hainová – Škoda Fabia RS Rally2 +2:47,1 9. Kohn / Whittock – Škoda Fabia RS Rally2 +2:50,1 10. Cvrček / Těšínský – Škoda Fabia RS Rally2 +3:11,1